Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPREP23469 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPREP23469 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPREP23469 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPREP23469 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPREP23469 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPREP23469 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPREP23469 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPREP23469 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPREP23469 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPREP23469 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPREP23469 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPREP23469 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPREP23469 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPREP23469 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPREP23469 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPREP23469 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPREP23469 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPREP23469 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPREP23469 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPREP23469 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPREP23469 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPREP23469 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPREP23469 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPREP23469 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPREP23469 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPREP23469 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPREP23469 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPREP23469 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPREP23469 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPREP23469 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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PTPREP23469 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPREP23469 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPREP23469 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPREP23469 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPREP23469 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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PTPREP23469 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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PTPREP23469 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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PTPREP23469 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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PTPREP23469 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPREP23469 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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PTPREP23469 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
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PTPREP23469 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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PTPREP23469 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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PTPREP23469 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPREP23469 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPREP23469 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPREP23469 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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PTPREP23469 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPREP23469 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPREP23469 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPREP23469 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPREP23469 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPREP23469 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPREP23469 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPREP23469 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPREP23469 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPREP23469 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPREP23469 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPREP23469 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPREP23469 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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