Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRTO14522 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRTO14522 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRTO14522 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRTO14522 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRTO14522 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRTO14522 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTPRTO14522 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTPRTO14522 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTPRTO14522 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-0.47□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRTO14522 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRTO14522 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 312.4 ms