Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LHX9Q9NQ69 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LHX9Q9NQ69 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LHX9Q9NQ69 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
LHX9Q9NQ69 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LHX9Q9NQ69 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LHX9Q9NQ69 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LHX9Q9NQ69 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LHX9Q9NQ69 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
LHX9Q9NQ69 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LHX9Q9NQ69 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LHX9Q9NQ69 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LHX9Q9NQ69 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LHX9Q9NQ69 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LHX9Q9NQ69 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
LHX9Q9NQ69 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LHX9Q9NQ69 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1154.5 ms