Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C17orf47Q8NEP4 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C17orf47Q8NEP4 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.9 ms