Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SKIDA1Q1XH10 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SKIDA1Q1XH10 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SKIDA1Q1XH10 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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