Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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PTPRNQ16849 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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PTPRNQ16849 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRNQ16849 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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PTPRNQ16849 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
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PTPRNQ16849 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRNQ16849 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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PTPRNQ16849 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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PTPRNQ16849 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRNQ16849 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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PTPRNQ16849 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRNQ16849 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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