Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
EXT1Q16394 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
EXT1Q16394 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 520.5 ms