Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NKX1-1Q15270 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NKX1-1Q15270 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NKX1-1Q15270 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NKX1-1Q15270 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NKX1-1Q15270 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NKX1-1Q15270 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NKX1-1Q15270 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NKX1-1Q15270 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NKX1-1Q15270 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NKX1-1Q15270 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NKX1-1Q15270 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NKX1-1Q15270 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NKX1-1Q15270 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NKX1-1Q15270 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NKX1-1Q15270 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NKX1-1Q15270 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NKX1-1Q15270 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NKX1-1Q15270 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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