Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
BNIP1Q12981 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
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BNIP1Q12981 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
BNIP1Q12981 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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BNIP1Q12981 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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BNIP1Q12981 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.54□□□□□ -2.5
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BNIP1Q12981 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
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BNIP1Q12981 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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BNIP1Q12981 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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BNIP1Q12981 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
BNIP1Q12981 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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