Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CHRNEQ04844 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CHRNEQ04844 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1976.5 ms