Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
RABGGTBP53611 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RABGGTBP53611 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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