Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF18Q99633 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRPF18Q99633 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRPF18Q99633 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRPF18Q99633 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRPF18Q99633 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRPF18Q99633 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRPF18Q99633 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRPF18Q99633 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRPF18Q99633 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRPF18Q99633 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRPF18Q99633 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRPF18Q99633 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRPF18Q99633 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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PRPF18Q99633 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRPF18Q99633 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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PRPF18Q99633 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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PRPF18Q99633 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRPF18Q99633 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRPF18Q99633 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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PRPF18Q99633 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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PRPF18Q99633 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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PRPF18Q99633 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRPF18Q99633 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRPF18Q99633 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRPF18Q99633 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRPF18Q99633 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRPF18Q99633 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRPF18Q99633 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PRPF18Q99633 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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PRPF18Q99633 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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PRPF18Q99633 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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