Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TPRNQ4KMQ1 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TPRNQ4KMQ1 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TPRNQ4KMQ1 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TPRNQ4KMQ1 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TPRNQ4KMQ1 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TPRNQ4KMQ1 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TPRNQ4KMQ1 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TPRNQ4KMQ1 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TPRNQ4KMQ1 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
TPRNQ4KMQ1 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TPRNQ4KMQ1 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TPRNQ4KMQ1 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TPRNQ4KMQ1 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TPRNQ4KMQ1 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TPRNQ4KMQ1 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TPRNQ4KMQ1 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TPRNQ4KMQ1 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TPRNQ4KMQ1 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TPRNQ4KMQ1 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TPRNQ4KMQ1 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TPRNQ4KMQ1 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TPRNQ4KMQ1 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TPRNQ4KMQ1 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TPRNQ4KMQ1 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
TPRNQ4KMQ1 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TPRNQ4KMQ1 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TPRNQ4KMQ1 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TPRNQ4KMQ1 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TPRNQ4KMQ1 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TPRNQ4KMQ1 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TPRNQ4KMQ1 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TPRNQ4KMQ1 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TPRNQ4KMQ1 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
TPRNQ4KMQ1 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TPRNQ4KMQ1 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TPRNQ4KMQ1 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TPRNQ4KMQ1 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TPRNQ4KMQ1 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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