Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SKIDA1Q1XH10 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SKIDA1Q1XH10 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 270 ms