Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNGB1Q14028 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNGB1Q14028 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNGB1Q14028 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CNGB1Q14028 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CNGB1Q14028 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CNGB1Q14028 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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