Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TNFAIP1Q13829 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TNFAIP1Q13829 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TNFAIP1Q13829 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TNFAIP1Q13829 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TNFAIP1Q13829 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TNFAIP1Q13829 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TNFAIP1Q13829 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TNFAIP1Q13829 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TNFAIP1Q13829 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TNFAIP1Q13829 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TNFAIP1Q13829 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TNFAIP1Q13829 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TNFAIP1Q13829 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TNFAIP1Q13829 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TNFAIP1Q13829 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TNFAIP1Q13829 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TNFAIP1Q13829 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TNFAIP1Q13829 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TNFAIP1Q13829 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
TNFAIP1Q13829 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.7 ms