Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-1□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CBX3Q13185 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CBX3Q13185 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 327 ms