Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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TRAF1Q13077 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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TRAF1Q13077 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
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TRAF1Q13077 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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TRAF1Q13077 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRAF1Q13077 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRAF1Q13077 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRAF1Q13077 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
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TRAF1Q13077 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF1Q13077 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF1Q13077 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF1Q13077 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF1Q13077 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAF1Q13077 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRAF1Q13077 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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TRAF1Q13077 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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TRAF1Q13077 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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TRAF1Q13077 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
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TRAF1Q13077 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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TRAF1Q13077 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAF1Q13077 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAF1Q13077 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAF1Q13077 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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TRAF1Q13077 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAF1Q13077 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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TRAF1Q13077 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAF1Q13077 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAF1Q13077 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRAF1Q13077 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRAF1Q13077 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRAF1Q13077 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRAF1Q13077 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRAF1Q13077 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TRAF1Q13077 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAF1Q13077 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAF1Q13077 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAF1Q13077 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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