Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GTF3C1Q12789 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 409.6 ms