Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERVPABLB-1P60509 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ERVPABLB-1P60509 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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