Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
C4orf46Q504U0 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C4orf46Q504U0 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
C4orf46Q504U0 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
C4orf46Q504U0 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C4orf46Q504U0 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C4orf46Q504U0 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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