Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
VAMP3Q15836 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
VAMP3Q15836 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
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