Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-3.24□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
HMGN3Q15651 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-3.32□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-3.32□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-3.33□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
HMGN3Q15651 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
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