Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
TRAM1Q15629 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TRAM1Q15629 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.5 ms