Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHHQ15465 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHHQ15465 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHHQ15465 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHHQ15465 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHHQ15465 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHHQ15465 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SHHQ15465 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHHQ15465 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHHQ15465 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHHQ15465 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHHQ15465 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHHQ15465 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHHQ15465 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHHQ15465 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHHQ15465 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHHQ15465 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHHQ15465 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHHQ15465 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHHQ15465 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHHQ15465 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SHHQ15465 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SHHQ15465 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHHQ15465 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHHQ15465 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHHQ15465 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHHQ15465 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHHQ15465 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHHQ15465 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHHQ15465 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHHQ15465 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHHQ15465 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SHHQ15465 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHHQ15465 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHHQ15465 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHHQ15465 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHHQ15465 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHHQ15465 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHHQ15465 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHHQ15465 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHHQ15465 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHHQ15465 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHHQ15465 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHHQ15465 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHHQ15465 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SHHQ15465 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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