Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GTF3C1Q12789 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GTF3C1Q12789 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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GTF3C1Q12789 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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GTF3C1Q12789 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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GTF3C1Q12789 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GTF3C1Q12789 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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