Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TTF1Q15361 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TTF1Q15361 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TTF1Q15361 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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