Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SSPNQ14714 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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