Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
MKRN4PQ13434 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
MKRN4PQ13434 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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