Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
NR1H3Q13133 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NR1H3Q13133 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
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