Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
FOXF1Q12946 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.1 ms