Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GGA3Q9NZ52 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GGA3Q9NZ52 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.37□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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