Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC142Q17RM4 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
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