Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CNN3Q15417 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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