Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN5AQ14524 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.4 ms