Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RIGQ13278 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RIGQ13278 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
RIGQ13278 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIGQ13278 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIGQ13278 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIGQ13278 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIGQ13278 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIGQ13278 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIGQ13278 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIGQ13278 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIGQ13278 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIGQ13278 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
RIGQ13278 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIGQ13278 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RIGQ13278 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
RIGQ13278 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
RIGQ13278 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
RIGQ13278 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIGQ13278 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIGQ13278 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIGQ13278 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIGQ13278 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIGQ13278 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIGQ13278 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIGQ13278 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIGQ13278 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIGQ13278 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIGQ13278 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIGQ13278 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIGQ13278 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIGQ13278 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIGQ13278 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RIGQ13278 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
RIGQ13278 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RIGQ13278 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RIGQ13278 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RIGQ13278 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RIGQ13278 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RIGQ13278 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RIGQ13278 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RIGQ13278 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RIGQ13278 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIGQ13278 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIGQ13278 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIGQ13278 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIGQ13278 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIGQ13278 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIGQ13278 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIGQ13278 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIGQ13278 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIGQ13278 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIGQ13278 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RIGQ13278 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIGQ13278 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIGQ13278 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIGQ13278 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIGQ13278 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIGQ13278 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIGQ13278 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIGQ13278 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RIGQ13278 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIGQ13278 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIGQ13278 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIGQ13278 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIGQ13278 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIGQ13278 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIGQ13278 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIGQ13278 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIGQ13278 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RIGQ13278 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.9 ms