Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAF1Q13077 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRAF1Q13077 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRAF1Q13077 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRAF1Q13077 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRAF1Q13077 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRAF1Q13077 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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TRAF1Q13077 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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TRAF1Q13077 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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TRAF1Q13077 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRAF1Q13077 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRAF1Q13077 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRAF1Q13077 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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TRAF1Q13077 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRAF1Q13077 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRAF1Q13077 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRAF1Q13077 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TRAF1Q13077 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRAF1Q13077 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRAF1Q13077 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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TRAF1Q13077 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRAF1Q13077 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRAF1Q13077 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRAF1Q13077 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRAF1Q13077 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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TRAF1Q13077 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
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