Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRTO14522 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRTO14522 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRTO14522 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRTO14522 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRTO14522 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRTO14522 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRTO14522 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRTO14522 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRTO14522 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRTO14522 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRTO14522 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRTO14522 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRTO14522 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRTO14522 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRTO14522 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRTO14522 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRTO14522 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRTO14522 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRTO14522 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRTO14522 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRTO14522 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRTO14522 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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