Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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