Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
VPS72Q15906 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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