Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TTF1Q15361 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TTF1Q15361 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TTF1Q15361 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 669.6 ms