Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZNF239Q16600 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF239Q16600 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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