Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDE3BQ13370 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDE3BQ13370 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDE3BQ13370 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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