Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.35
LINC00336Q6ZUF6 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
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LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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LINC00336Q6ZUF6 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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LINC00336Q6ZUF6 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00336Q6ZUF6 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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