Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
VAMP3Q15836 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-1.02□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VAMP3Q15836 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
VAMP3Q15836 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
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