Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
RAB35Q15286 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
RAB35Q15286 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
RAB35Q15286 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RAB35Q15286 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RAB35Q15286 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RAB35Q15286 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RAB35Q15286 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RAB35Q15286 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RAB35Q15286 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
RAB35Q15286 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
RAB35Q15286 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RAB35Q15286 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RAB35Q15286 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RAB35Q15286 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RAB35Q15286 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RAB35Q15286 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RAB35Q15286 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RAB35Q15286 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RAB35Q15286 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RAB35Q15286 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RAB35Q15286 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RAB35Q15286 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RAB35Q15286 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
RAB35Q15286 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
RAB35Q15286 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RAB35Q15286 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RAB35Q15286 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RAB35Q15286 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RAB35Q15286 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RAB35Q15286 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RAB35Q15286 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.6 ms