Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KARSQ15046 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KARSQ15046 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
KARSQ15046 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KARSQ15046 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KARSQ15046 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KARSQ15046 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KARSQ15046 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KARSQ15046 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KARSQ15046 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KARSQ15046 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.32□□□□□ -2.36
KARSQ15046 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KARSQ15046 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KARSQ15046 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KARSQ15046 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KARSQ15046 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KARSQ15046 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KARSQ15046 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KARSQ15046 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KARSQ15046 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KARSQ15046 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
KARSQ15046 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
KARSQ15046 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
KARSQ15046 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
KARSQ15046 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
KARSQ15046 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
KARSQ15046 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
KARSQ15046 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
KARSQ15046 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
KARSQ15046 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
KARSQ15046 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
KARSQ15046 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
KARSQ15046 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
KARSQ15046 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
KARSQ15046 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
KARSQ15046 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
KARSQ15046 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
KARSQ15046 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
KARSQ15046 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
KARSQ15046 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
KARSQ15046 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
KARSQ15046 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
KARSQ15046 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
KARSQ15046 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
KARSQ15046 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
KARSQ15046 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
KARSQ15046 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
KARSQ15046 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
KARSQ15046 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
KARSQ15046 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
KARSQ15046 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
KARSQ15046 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
KARSQ15046 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
KARSQ15046 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
KARSQ15046 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
KARSQ15046 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
KARSQ15046 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
KARSQ15046 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
KARSQ15046 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
KARSQ15046 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
KARSQ15046 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
KARSQ15046 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
KARSQ15046 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
KARSQ15046 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
KARSQ15046 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
KARSQ15046 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
KARSQ15046 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
KARSQ15046 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
KARSQ15046 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
KARSQ15046 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
KARSQ15046 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KARSQ15046 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KARSQ15046 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KARSQ15046 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KARSQ15046 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
KARSQ15046 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KARSQ15046 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KARSQ15046 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KARSQ15046 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KARSQ15046 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KARSQ15046 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KARSQ15046 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KARSQ15046 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KARSQ15046 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KARSQ15046 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KARSQ15046 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KARSQ15046 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KARSQ15046 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KARSQ15046 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KARSQ15046 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KARSQ15046 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KARSQ15046 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KARSQ15046 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KARSQ15046 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KARSQ15046 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KARSQ15046 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KARSQ15046 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KARSQ15046 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KARSQ15046 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KARSQ15046 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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