Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
MKRN4PQ13434 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.81
MKRN4PQ13434 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
MKRN4PQ13434 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.3 ms