Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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SGCAQ16586 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SGCAQ16586 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SGCAQ16586 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SGCAQ16586 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SGCAQ16586 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SGCAQ16586 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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SGCAQ16586 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SGCAQ16586 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SGCAQ16586 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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SGCAQ16586 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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SGCAQ16586 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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SGCAQ16586 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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SGCAQ16586 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SGCAQ16586 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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SGCAQ16586 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SGCAQ16586 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SGCAQ16586 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SGCAQ16586 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SGCAQ16586 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SGCAQ16586 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SGCAQ16586 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SGCAQ16586 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SGCAQ16586 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
SGCAQ16586 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.2□□□□□ -2.38
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SGCAQ16586 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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SGCAQ16586 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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SGCAQ16586 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SGCAQ16586 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SGCAQ16586 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SGCAQ16586 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SGCAQ16586 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SGCAQ16586 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SGCAQ16586 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SGCAQ16586 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SGCAQ16586 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SGCAQ16586 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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