Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SGCBQ16585 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SGCBQ16585 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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